Otros grupos colaboradores
Microbiomas Ambientales y Biotecnología del RNA
Datos de la entidad en la que trabaja el grupo
NOMBRE DE LA ENTIDAD: Universidad de Cantabria
SIGLAS: UC
TIPO DE ENTIDAD: Universidad
CENTRO: Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria
DEPARTAMENTO: Microbiología Molecular
TELÉFONO (indicar prefijos, número y extensión): 942 20 67 99 (Ext. 25932)
DIRECCIÓN POSTAL: C/ Albert Einstein 22, 39011 Santander
CIUDAD: Santander
PROVINCIA: Cantabria
PÁGINA WEB: Microbiomas Ambientales y Biotecnología del RNA
RR.SS. del grupo: –
Doctores dentro del grupo (* responsable)
Marta Robledo Garrido(*)
Natalia García Tomsig
Líneas de investigación del grupo
| 1. Mecanismos de coevolución del microbioma endófito de semillas y sus plantas huésped |
| 2. Dinámica funcional, genómica, RNómica y estructura del microbioma “core” de semillas. |
| 3. Aplicación de métodos de control específicos contra patógenos bacterianos dentro de comunidades bacterianas nativas complejas. |
| 4. Desarrollo de soluciones respetuosas con el medio ambiente para prevenir o tratar la plaga global emergente Xylella fastidiosa |
| 5. Mejora de bioestimulantes agrícolas a través de factores promotores del crecimiento vegetal portátiles |
Equipos y metodologías singulares empleados por el grupo
| EQUIPO | METODOLOGÍA |
| 1. Microbiología molecular y genética bacteriana: | Manipulación genética, construcción de mutantes, estudios de expresión génica y análisis funcional de interacciones bacteria‑planta. |
| 2. Caracterización de microbiomas | Metagenómica, secuenciación de amplicones, análisis de comunidades y pipelines bioinformáticos propios |
| 3. Microscopía avanzada y microfluídica | Seguimiento espacial y temporal de poblaciones microbianas mediante confocal y dispositivos microfluídicos, incluso en condiciones de contención. |
| 4. Experimentación en plantas: | Cultivos controlados, ensayos de colonización, fenotipado y evaluación de rasgos PGP en modelos como Arabidopsis y trigo |
| 5. Biotecnología microbiana aplicada: | Formulación, estabilidad y validación de bioinoculantes, en colaboración con socios industriales. |
| EQUIPO / METODOLOGÍA |
1. Microbiología molecular y genética bacteriana: manipulación genética, construcción de mutantes, estudios de expresión génica y análisis funcional de interacciones bacteria‑planta. |
2. Caracterización de microbiomas: metagenómica, secuenciación de amplicones, análisis de comunidades y pipelines bioinformáticos propios. |
3. Microscopía avanzada y microfluídica: seguimiento espacial y temporal de poblaciones microbianas mediante confocal y dispositivos microfluídicos, incluso en condiciones de contención. |
4. Experimentación en plantas: cultivos controlados, ensayos de colonización, fenotipado y evaluación de rasgos PGP en modelos como Arabidopsis y trigo. |
| 5. Biotecnología microbiana aplicada: formulación, estabilidad y validación de bioinoculantes, en colaboración con socios industriales. |
Colaboraciones con otros grupos nacionales e internacionales
Ronnie de Jonge
Utrecht University, Holanda
César de la Fuente
U. Pennsylvania, USA
Andrea Chini
CNB, Spain
José I. Jiménez-Zurdo
EEZ, CSIC, España
Cecilia Arraiano
Universidade Nova de Lisboa, Portugal)
Andreas Börner
Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Germany
Óscar Lorenzo
CIALE, U. Salamanca, España
Anke Becker
Marburg Universität, Germany
Proyectos y contratos de investigación activos
TÍTULO DEL PROYECTO | CÓDIGO Y PERIODO DE DURACIÓN |
| IP: Marta Robledo (2025-2028) SEEDBIOSIS. “Coevolution of the Seed Symbiotic Microbiome with Host Plants”. Proyectos de Generación de Conocimiento. | Spanish National Research Plan PID2024-155420OB-I00 Duración: 2025-2028 |
| IP: Marta Robledo. (2026) DEEP-X. “AI-Driven Discovery of Encrypted Endogenous Peptides Targeting the Phytopathogen Xylella fastidiosa.” | Proyecto Intramural del MAX-CSIC para el IBBTEC. |
Marta Robledo y Fernando de la Cruz (2023-2026) BREED-SAGE. “Bacterial Breeding with Portable Plant Growth Traits for Sustainable Agriculture”. | (CPP2022-009595). Public-private collaboration call of the Spanish National Research Plan. Biomar MT-Universidad de Cantabria.(2023-2026) |
| IP: Marta Robledo. Años 2024-2029 Ramón y Cajal research award. Spanish Ministry of Economy and Competence | Spanish Ministry of Economy and Competence. Años 2024-2029 |
Marta Robledo y Fernando de la Cruz (2022-2025) “Microbiología y Genómica de microorganismos de interés biotecnológico” Research contract (Biomar MT-U. de Cantabria contract). | Research contract (Biomar MT-U. de Cantabria contract).(2022-2025) |
TÍTULO DEL PROYECTO / CÓDIGO Y PERIODO DE DURACIÓN |
| IP: Marta Robledo (2025-2028) SEEDBIOSIS. “Coevolution of the Seed Symbiotic Microbiome with Host Plants”. Proyectos de Generación de Conocimiento. Spanish National Research Plan PID2024-155420OB-I00 |
| IP: Marta Robledo (2025-2028) SEEDBIOSIS. “Coevolution of the Seed Symbiotic Microbiome with Host Plants”. Proyectos de Generación de Conocimiento. Spanish National Research Plan PID2024-155420OB-I00 |
Marta Robledo y Fernando de la Cruz (2023-2026) BREED-SAGE. “Bacterial Breeding with Portable Plant Growth Traits for Sustainable Agriculture”. (CPP2022-009595). Public-private collaboration call of the Spanish National Research Plan. Biomar MT-Universidad de Cantabria. |
IP: Marta Robledo. Años 2024-2029 Ramón y Cajal research award. Spanish Ministry of Economy and Competence. |
Marta Robledo y Fernando de la Cruz (2022-2025) “Microbiología y Genómica de microorganismos de interés biotecnológico” Research contract (Biomar MT-U. de Cantabria contract). |
10 publicaciones representativas (últimos 5 años)
1. García-Tomsig NI, Guedes-García SK, Robledo M, Jiménez-Zurdo JI “A single small RNA shapes multiple symbiotic traits in rhizobia”, Microbiological Research. Accepted for publication. DOI: 1101/2025.11.14.688489 |
| 2. Sanz-Puente I., Redondo-Salvo S., Torres-Cortés G., de Toro M, Fernandes S, Börner S, Lorenzo O, de la Cruz F, Robledo M “Seed-mediated vertical transmission of Pantoea core endophytes” The Isme Journal, Volume 19, Issue 1, January 2025, wraf192. https://doi.org/10.1093/ismejo/wraf192. |
| 3. García-Tomsig NI, García-Rodriguez FM, Guedes-García SK, Millán V, Becker A, Robledo M, Jiménez-Zurdo JI “A double-negative feedback loop between NtrBC and a small RNA rewires nitrogen metabolism in legume symbionts”, mBio 2023 Dec 19;14(6):e0200323. doi: 10.1128/mbio.02003-23. Epub 2023 Oct 18. |
| 4. Robledo M, Álvarez B, Cuevas A, González S, Ruano-Gallego D, Fernández LA and de la Cruz F “Targeted bacterial conjugation mediated by synthetic cell-to-cell adhesions” Nucleic Acids Research, Volume 50, Issue 22, 9 December 2022, Pages 12938–12950, https://doi.org/10.1093/nar/gkac1164 |
| 5. Beroual W, Prévost K, Lalaouna D, Ben Zaina N, Valette O, Denis Y, Djendli M, Brasseur G, Brilli M, Robledo Garrido M, Jimenez-Zurdo JI, Massé E, Biondi EG. “The noncoding RNA CcnA modulates the master cell cycle regulators CtrA and GcrA in Caulobacter crescentus” PLoS Biol. 2022 Feb 22;20(2):e3001528. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001528 |
| 6. García-Tomsig NI, Robledo M, diCenzo GC, Mengoni A, Millán V, Peregrina A, Uceta A, Jiménez-Zurdo JI “Pervasive RNA regulation of metabolism enhances the root colonization ability of nitrogen-fixing symbiotic α- rhizobia” ASM Journals mBio February 2022 Vol. 13, No. 1 https://doi.org/10.1128/mbio.03576-21. |
| 7. ROBLEDO M et al. 2021.” Synthetase of the methyl donor S-adenosylmethionine from nitrogen-fixing α-rhizobia can bind functionally diverse RNA species”. RNA biology. 18 (8):1111-23. https://doi.org/10.1080/15476286.2020.1829365 |
| 8. García-Tomsig NI, Guedes-García SK, Robledo M, Jiménez-Zurdo JI “Riboregulation in nitrogen-fixing endosymbiotic bacteria” 2020, Microorganisms. 8 (3):384 |
| 9. García-Tomsig NI, Guedes-García SK, Jiménez-Zurdo JI “A Workflow for the Functional Characterization of Noncoding RNAs in Legume Symbiotic Bacteria”, In: Medina, C., López-Baena, F.J. (eds) Host-Pathogen Interactions. Methods in Molecular Biology, vol 2751. Humana, New York, NY. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-3617-6_12 |
| 10. García-Tomsig, N.I., Lagares, A., Becker, A., Valverde, C., Jiménez-Zurdo, J.I. (2024). An Integrated Affinity Chromatography-Based Approach to Unravel the sRNA Interactome in Nitrogen-Fixing Rhizobia. In: Arluison, V., Valverde, C. (eds) Bacterial Regulatory RNA. Methods in Molecular Biology, vol 2741. Humana, New York, NY. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-3565-0_19 |